Один из старейших клубов страны был основан в 1907 году.
Команда неоднократно меняла название. После имени, данного при «рождении» — «Олимпия», новороссийский коллектив менял вывеску на «Динамо», «Строитель», «Труд», «Цемент», «Гекрис», а с 1992 года стал «Черноморцем» (в сезоне-2005 коллектив переименовали в «Новороссийск», но в следующем году вернули нынешнее название).
В 1988 году «Черноморец» совершил «золотой дубль», получив звание чемпиона и титул обладателя Кубка РСФСР.
Трижды (1969, 1988, 1989) становился победителем зоны во второй лиге СССР.
Звездным часом новороссийцев в новейшей истории стало шестое место в классе сильнейших в сезоне-2000, что позволило дружине из Краснодарского края дебютировать на международной арене – в Кубке УЕФА. Впрочем, дальше 1/64-й финала пройти не удалось – «Черноморец» остановила испанская «Валенсия».
Новороссийцы выступали во всех профессиональных эшелонах России, а в последние годы, как и динамовцы, обосновались во втором дивизионе.
Сейчас динамовцы и «черные моряки» расположились на соседних этажах в турнирной таблице седьмом и восьмом местах соответственно.
История встреч «Динамо» и «Черноморца»
В чемпионате СССР: 18 игр – 12 побед «Динамо», 1 ничья, 5 поражений, мячи – 29:17.
В чемпионате России: 23 игры – 2 победы «Динамо», 4 ничьи, 17 поражений, мячи – 13:53.
В Кубке России: 2 игры – 1 победа «Динамо», 1 поражение, мячи – 2:4.
Всего: 43 игры – 15 побед «Динамо», 5 ничьих, 23 поражения, мячи – 44:74.
История последних встреч «Динамо» и «Черноморца»
- 21.09.2019 г. «Черноморец» — «Динамо» — 3:0
- 04.10.2020 г. «Черноморец» — «Динамо» — 1:0
- 21.04.2021 г. «Динамо» — «Черноморец» — 1:1
- 17.10.2021 г. «Динамо» — «Черноморец» — 1:1
- 12.05.2022 г. «Черноморец» — «Динамо» — 3:0